نظرا لأهمية العقل الجمعي، فقد كان يتمّ اختيار مجلس الإدارة و مجلس الأمناء في مكتب الاعلام الاسلامي من قبل الولي الفقيه و في آخر حكم كان قد أصدره سماحة قائد الثورة الإسلامية في 13/3/2007 فقد تمّ اختيار أحد عشر شخصية علمية و ثقافية و من ضمنهم أصحاب السماحة حجج الإسلام و المسلمين السادة محمد جعفر جيلاني، و حسن ربّاني، و عباس صالحي، و عبدالرضا أيزد پناه، و حميد بارسا نيا، و محمد تقي سبحاني، و أحمد واعظي، و أحمد عابدي، و علي رضا اميني، إضافة إلي رئيس منظمة الإعلام الإسلامي و مسؤول معاونيّة الإعلام في مديرية الحوزة العلمية بقم كأعضاء في مجلس أمناء المكتب لمدّة أربع سنين، فيما تمّ اختيار سماحة حجة الإسلام السيد حسن الرباني رئيسا للمكتب و سماحة الشيخ محمّد جعفري جيلاني كرئيس لمجلس الامناء.
و تعد هيئة الأمناء المرجع الأعلي لرسم سياسات مكتب الإعلام الإسلامي.